بیان ژن افتراقی پس از جایگزینی کل پودر ماهی و روغن جیره ماهی با محصولات گیاهی در کبد قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss)

چکیده:

هدف ما تجزیه و تحلیل ترانسکریپتوم های[1] کبدی قزل آلای رنگین کمان نابالغ بود که با یک جیره غذایی بر پایه گیاه تغذیه شد. ما برای این آزمایش، بر جایگزینی کل پودر ماهی (FM) و روغن ماهی (FO) توسط یک رژیم غذایی 100٪ گیاهی (0% FM، 0٪ FO ) تمرکز کردیم. ما ترانسکریپتوم های کبدی قزل آلای رنگین کمان را 8 ساعت پس از تغذیه با دو جیره غذایی، تجزیه و تحلیل کردیم. شش تا از کل RNA های کبدی از هر گروه جیره ای در برابر  microarray   [2]cDNA قزل آلا به هم جفت شدند (k9). پس از آنالیز اطلاعات حاصل از پروتکل استاندارد MIAME (حداقل اطلاعات درباره یک آزمایشmicroarray) ، ما متوجه شدیم که 176 ژن کبدی، بین ماهیان تغذیه شده با دو جیره غذایی، به طور متفاوت بیان می شوند: در قزل آلا تغذیه شده با جیره گیاهی، به ترتیب، 96 ژن بیشتر بیان شدند و 80 ژن کمتر بیان شدند. اکثر ژنهایی که متفاوت بیان شدند در متابولیسم بدن (57٪)، و بقیه در فرایندهای سلولی (21٪) و حمل و نقل (10٪) درگیر بودند. در بین ژنهای درگیر در سوخت و ساز بدن  (N = 86)، 37٪ با متابولیسم پروتئین (پروتئولیز، کاتابولیسم اسید آمینه)، 21٪ با سوخت و ساز چربی (بیوسنتز اسید چرب، بیوسنتز کلسترول)، 30٪ با متابولیسم اسید نوکلئیک و 8٪ با متابولیسم گلوکز در ارتباط بودند. به ویژه، ما دریافتیم که در قزل آلای رنگین کمان تغذیه شده با 100٪ جیره گیاهی، بیان بیش از حدی در ژن های دخیل در بیوسنتز چربی (متابولیسم کلسترول و غیر اشباع سازیِ اسیدهای چرب با چندین باند دوگانه)، و همچنین افزایش در بیان یک متابولیک جدید، به عنوان مثال، گلیسرول کیناز مشاهده می شود که نقشی کلیدی به عنوان یک واسطه در متابولیسم گلوکز - چربی بازی می کند. در مجموع، این اطلاعات نشان می دهد که تعدادی از اثرات متابولیک واسطه ای در قزل آلای تغذیه با یک جیره غذایی کاملا گیاهی، رخ می دهد.